db 가 안열리는거 같은데요~
config 에 디비 이름 확인해보세요~

백업으로 디비를 연다음에.. 해당 디비를 덤프해서 sql 파일로 저장하시고
나비켓에 new database 만드신 다음에 excute sqp file 하셔서 다시 열어 보세요.
config 에서 다시 연 db 이름으로 설정하시고용

java 버전 몇 버전 설치 하셧습니까?

자바 버전은 이상 없는데요
자바 1.8
mysql 5.5
서버 구동 환경은 맞는거 같은데요

데이터 베이스명은 맞게 적으셧나요?
server.config 파일에서요

증상은 서버팩이 데이터 베이스에 연결을 못 하고 있다는 증상 으로 보여져요
mysql 비번인지, 아니면 데이터베이스명이 일치 하지 않는것인지.
또는 간혹 mysql 신버전에서는 데이터베이스에 한번 접속을 해야지
서버와 연결이 되는 상황도 있습니다

mysql 5.5 설치해보세요